Pero sobre todo Haigerloch es conocido en relación a la energía atómica.
En 1944, con Berlin siendo bombardeado intensamente día y noche, los científicos del Kaiser-Wilheim-Institut für Physik de Berlín deciden trasladarse a un lugar apartado para poder seguir con sus investigaciones sobre la energía atómica. En Haigerloch alquilaron una antigua bodega, situada al pie del castillo, bajo la roca y allí construiyeron un reactor nuclear.
El reactor consistía en 664 cubos de uranio sumergidos en agua pesada.Esquema del reactor:
Depósitos de agua pesada:El 23 de abril de 1945, las tropas de los EEUU ocupan el pueblo y descubren el reactor.
Lo desmontan pieza a pieza enterrando los cubos de uranio sin protección en un campo en los alrededores.
Los científicos capturados son trasladados a los EEUU dentro de la Operación Epsilon para obtener información del programa nuclear nazi. Se descubrió que los nazis no consiguieron pasar de la fase teórica y que la posible construcción de una bomba atómica nazi hubiera sido necesarios muchos mas años.
Actualmente se puede visitar la bodega convertida en museo con una réplica del reactor: es el Atomkeller-Museum



No obstante, la Naturaleza siempre se las ingenia para salir adelante y en la actualidad tanto los Monegros como el Delta del Ebro poseen ricos, variados y únicos ecosistemas.